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MEF to induced endoderm progenitors reprogramming

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Figshare2021-06-28 更新2026-04-08 收录
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https://figshare.com/articles/dataset/MEF_reprogramming/13105481/3
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资源简介:
scRNA-seq time-series dataset of mouse embryonic fibroblast (MEF) reprogramming to induced endoderm progenitors (iEPs)assayed using Dropseq and 10x Genomics. Contains 8 time points spanning days 0-28 during reprogramming. Total cell number is 104,887.<br>This dataset contains raw spliced and unspliced counts estimated using the velocyto pipeline (La Manno et al., Nature 2018) that can be used to compute RNA velocity. Further, this dataset contains clonal information from CellTagging.<br>Please cite the original publication: https://doi.org/10.1038/s41586-018-0744-4

本数据集为小鼠胚胎成纤维细胞(mouse embryonic fibroblast, MEF)重编程为诱导内胚层祖细胞(induced endoderm progenitors, iEPs)的单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)时间序列数据集,采用Dropseq与10x Genomics技术进行检测。该数据集涵盖重编程过程中第0至28天的8个时间节点,总细胞数达104887个。<br>本数据集包含通过velocyto分析流程(La Manno等,《自然》2018年)估算得到的原始剪接计数与未剪接计数,可用于计算RNA速率。此外,本数据集还包含来自CellTagging技术的克隆信息。<br>请引用原始文献:https://doi.org/10.1038/s41586-018-0744-4
提供机构:
Klein, Michal; Lange, Marius
创建时间:
2021-06-28
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