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APPENDIX 3 in The Amidella clade in Europe (Basidiomycota: Amanitaceae): clarification of the contentious Amanita valens (E. - J. Gilbert) Bertault and the importance of taxon-specific PCR primers for identification

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Zenodo2025-04-05 更新2026-05-26 收录
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APPENDIX 3. — Usefulness of the taxon-specific primers for the generation of PCR amplicons from herbarium specimens’ DNA. ITS-I and ITS-II represent the first and second nrDNA intron, respectively, and LSU represents the proximal region of the 26S nrDNA. a, https://sites.duke.edu/vilgalyslab/rdna_primers_for_fungi (accessed on May 15 th 2021). TaxonSpecimenITS-IITS-IILSUCommentAmanita lepiotoidesG08ITS1F- Ale Ir1Ale If1-ITS4BaLR0R- Ale Lr1–f. subcylindrosporaAle Lf1-LR3aAle Lf1-LR5Amanita ponderosaG73Apo If1-ITS2_KYO2Apo If2-ITS4NLC2R- Apo Lr1–f. valensAmanita pseudovalens G74SR6Ra- Aps Ir1Aps If1-NLC2Aps Lf1- Aps Lr2–comb. nov.MPU1ITS1F- Aps Ir1Aps If1-ITS4LR0R- Aps LR1All regions afterNLC2R- Aps Lr2reamplificationMPU2SR6R- Aps Ir1Aps If1-ITS4Aps Lf1- Aps Lr2ITS-II region afterreamplification

附录3. 分类群特异性引物用于从蜡叶标本DNA中扩增聚合酶链式反应(PCR)产物的有效性。内转录间隔区I(ITS-I)与内转录间隔区II(ITS-II)分别代表核核糖体DNA(nrDNA)的第一、第二内含子,大亚基(LSU)则代表26S核核糖体DNA的近端区域。注a:https://sites.duke.edu/vilgalyslab/rdna_primers_for_fungi(访问时间:2021年5月15日)。 1. 鳞柄鹅膏(Amanita lepiotoides),标本编号G08:ITS-I区域引物为ITS1F- Ale Ir1、Ale If1-ITS4;ITS-II区域无可用引物;LSU区域引物为BaLR0R- Ale Lr1 f. subcylindrospora、Ale Lf1-LR3a、Ale Lf1-LR5;无备注。 2. 重固鹅膏(Amanita ponderosa),标本编号G73:ITS-I区域引物为Apo If1-ITS2_KYO2、Apo If2-ITS4;ITS-II区域无可用引物;LSU区域引物为NLC2R- Apo Lr1 f. valens;无备注。 3. 假亚绒盖鹅膏(Amanita pseudovalens),标本编号G74:ITS-I区域引物为SR6Ra- Aps Ir1、Aps If1-NLC2;ITS-II区域无可用引物;LSU区域引物为Aps Lf1- Aps Lr2(新组合comb. nov.);无备注。 4. 假亚绒盖鹅膏(Amanita pseudovalens),标本编号MPU1:ITS-I区域引物为ITS1F- Aps Ir1、Aps If1-ITS4;ITS-II区域无可用引物;LSU区域引物为LR0R- Aps LR1、NLC2R- Aps Lr2;备注为所有区域经再扩增后。 5. 假亚绒盖鹅膏(Amanita pseudovalens),标本编号MPU2:ITS-I区域引物为SR6R- Aps Ir1、Aps If1-ITS4、Aps Lf1- Aps Lr2;ITS-II区域经再扩增;LSU区域无可用引物;无备注。

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Zenodo
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2025-04-04
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