MD simulation of POPI-POPC (60:40) bilayer with CHARMM36 force field

Dataset contains simulation files of MD simulation with POPI-POPC (60:40) bilayer in CHARMM36 force field with neutralizing NH4+ ions System: POPI-POPC (60:40) bilayer in water Number of lipids: 200 (100/leaflet) Number of waters: 10000 Salt: Neutralizing NH4+ Number of cations: 120 Simulation time: 500 ns Sampling rate: every 10 ps Simulation engine: GROMACS 2022.4 Force field: CHARMM36 (parameters as charmm-gui input files 2.11.2023) Temperature: 310 K Equilibration: 100 ns (equilibration period in the uploaded trajectory, evaluated based on area per lipid) Pre-equilibration: 2.8 ns本数据集包含采用CHARMM36力场、带有中和性NH4+离子的POPI-POPC（60:40）双层膜的分子动力学（Molecular Dynamics, MD）模拟文件。 【模拟体系】：水溶液中的POPI-POPC（60:40）双层膜 【脂质总数】：200个（每个单层膜含100个） 【水分子总数】：10000个 【盐体系】：中和性NH4+盐 【阳离子总数】：120个 【模拟时长】：500纳秒（ns） 【采样频率】：每10皮秒（ps）采集一次 【模拟引擎】：GROMACS 2022.4 【力场】：CHARMM36（参数取自2023年2月11日的charmm-gui输入文件） 【模拟温度】：310开尔文（K） 【平衡阶段】：100纳秒（上传轨迹中的平衡周期，通过单位脂质面积进行评估） 【预平衡阶段】：2.8纳秒