Empirical results of PCR using different nifH primer sets with DNA from isolates and soilsa.

aDNA samples and their phylogenetic affiliation in the nifH phylogeny from Figure S2 are: Desulfovibrio vulgaris Hildenborough (Dv), cluster III; Geobacter uraniireducens Rf4 (Gu), subcluster IA; Azotobacter vinelandii DJ (Av), Alpha-, Beta- and Gamma-Proteobacteria; Frankia sp. CcI3 (Fs), Frankia; Mastigocladus laminosus UTEX LB 1931 (Ml), Cyanobacteria; Klebsiella pneumoniae 342 (Kp), Alpha-, Beta- and Gammaproteobacteria; Xanthobacter autotrophicus Py2 (Xa), Alpha-, Beta- and Gammaproteobacteria; Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 (Rs), Alpha-, Beta- and Gammaproteobacteria; Rhizobium leguminosarium bv. trifolii (Rl), Alpha-, Beta- and Gammaproteobacteria; Polaromonas naphthalenivorans CJ2 (Pn), Alpha-, Beta- and Gammaproteobacteria; Eschericia coli (Ec), genomic-DNA negative control; agricultural soil (AS); lawn soil (LS); No Template Control (NT). The symbols used are: product of the correct size (+), no product produced (−), non-specific amplification producing multiple bands or a single band of the wrong size (ns), a smeared band of indiscriminate size overlapping in size with the expected product (s). Blank cells indicate that the evaluation was not performed.bAnnealing Temperature (AT) used in PCR.来自图S2中固氮酶铁蛋白基因（nifH）系统发育树的古代DNA（aDNA）样本及其系统发育归属如下：脱硫弧菌属寻常脱硫弧菌希登堡株（Dv），归类于簇III；地杆菌属铀还原地杆菌Rf4株（Gu），归类于亚簇IA；维涅兰德固氮菌DJ株（Av），归类于α-、β-及γ-变形菌门；弗兰克氏菌CcI3菌株（Fs），归类于弗兰克氏菌属；层理鞭枝藻UTEX LB 1931株（Ml），归类于蓝细菌门；肺炎克雷伯菌342株（Kp），归类于α-、β-及γ-变形菌门；自养黄色杆菌Py2株（Xa），归类于α-、β-及γ-变形菌门；球形红杆菌2.4.1株（Rs），归类于α-、β-及γ-变形菌门；菜豆根瘤菌三叶草生物型（Rl），归类于α-、β-及γ-变形菌门；萘降解极胞菌CJ2株（Pn），归类于α-、β-及γ-变形菌门；大肠杆菌（Ec），作为基因组DNA阴性对照；农业土壤样本（AS）；草坪土壤样本（LS）；无模板对照（NT）。 所用符号的定义为：扩增产物长度符合预期记为（+），无扩增产物产生记为（−），出现非特异性扩增（产生多条条带或单一条带大小与预期不符）记为（ns），出现弥散条带且其大小与预期产物重叠无法区分记为（s）。空白单元格表示未开展该项评估。 b 聚合酶链式反应（PCR）所用退火温度（AT）。