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Quantification of isoforms expressed in the venom samples.

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NIAID Data Ecosystem2026-05-02 收录
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https://figshare.com/articles/dataset/Quantification_of_isoforms_expressed_in_the_venom_samples_/29801893
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MSFragger was set up to search a reverse concatenated in-house database consisting of the protein sequences predicted from a non-redundant master set containing venom toxins annotated from the transcriptome of venom glands from SB831, SB833, SB834, and SB1130 specimens, assuming the digestion by trypsin. The Normalized Total Spectra Counting (NTSC) was used to estimate the abundance of independent proteins and toxin groups. (S2_Table.XLSX)

本研究中设置MSFragger对反向串联式内部自建数据库进行检索,该数据库包含由SB831、SB833、SB834及SB1130样本的毒腺转录组注释得到的毒液毒素所构成的非冗余主集所预测的蛋白质序列,并设定酶解方式为胰蛋白酶酶解。本研究采用归一化总谱计数(Normalized Total Spectra Counting,NTSC)对单个蛋白质及毒素类群的相对丰度进行估算。(S2_Table.XLSX)
创建时间:
2025-08-01
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