Measurements of ex vivo human corneal endothelium using Voronoi segmentation.
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资源简介:
This dataset of size and shape measurements of 354,998 human corneal endothelial cells, from 2000 routine assessment images, from a sequential series of 678 corneas from 351 donors, was collected with consent by the New Zealand National Eye Bank over several years, after organ-culture storage but prior to release for transplantation. The measurement methodology using Voronoi segmentation is detailed in:
Brookes NH. Morphometry of organ-cultured corneal endothelium using Voronoi segmentation. Cell Tiss Bank. 2017; 18: 167-183. https://doi.org/10.1007/s10561-017-9622-9 PMID: 28374155.
Dataset structure:
1.Dataset ID2.Image Number3.Image - Mean Cell Area (µm^2)4.Image - Standard Error of the Mean (SEM) Cell Area (µm^2)5.Image - Total Cell Area (µm^2)6.Image - Cell Area Coefficient of Variation (CV)7.Image - Mean Cell Density (cells/mm^2)8.Image - SEM Cell Density (cells/mm^2)9.Image - 4-Sides Cell Count10.Image - 5-Sides Cell Count11.Image - 6-Sides Cell Count12.Image - 7-Sides Cell Count13.Image - 8-Sides Cell Count14.Image - 9-Sides Cell Count15.Image - 4-Sides Cell Area (µm^2)16.Image - 5-Sides Cell Area (µm^2)17.Image - 6-Sides Cell Area (µm^2)18.Image - 7-Sides Cell Area (µm^2)19.Image - 8-Sides Cell Area (µm^2)20.Image - 9-Sides Cell Area (µm^2)21.Image - 4-Sides % Area22.Image - 5-Sides % Area23.Image - 6-Sides % Area24.Image - 7-Sides % Area25.Image - 8-Sides % Area26.Image - 9-Sides % Area27.Image - Total Cells28.Image - Mean Hexagonal Cell Regularity29.Image - SEM Hexagonal Cell Regularity30.Image - Number of Pleomorphs31.Image - Mean Cell Sides32.Image - SEM Cell Sides33.Image - Cell Sides CV34.Image - Mean Shape Index35.Image - SEM Shape Index36.Cell Number37.Cell - Cell Area (µm^2)38.Cell - Number of Sides39.Cell - Hexagonal Cell Regularity40.Cell - Shape Index
本数据集收录了354998个人类角膜内皮细胞的尺寸与形态测量数据,样本源自2000幅常规评估图像,涵盖来自351名供体的678份角膜的连续序列样本。该数据集由新西兰国家眼库(New Zealand National Eye Bank)在获得受试者知情同意后,历经数年收集完成,采集时点为器官培养储存后、正式发放用于移植前。
其采用的沃罗诺伊(Voronoi)分割测量方法详见下述文献:
Brookes NH. 基于沃罗诺伊分割的器官培养角膜内皮细胞形态计量学研究. 细胞与组织银行(Cell Tiss Bank). 2017; 18: 167-183. https://doi.org/10.1007/s10561-017-9622-9 PMID: 28374155.
数据集结构如下:
1. 数据集ID
2. 图像编号
3. 图像-平均细胞面积(µm²)
4. 图像-细胞面积均值标准误(Standard Error of the Mean, SEM)(µm²)
5. 图像-总细胞面积(µm²)
6. 图像-细胞面积变异系数(Coefficient of Variation, CV)
7. 图像-平均细胞密度(cells/mm²)
8. 图像-细胞密度均值标准误(SEM)(cells/mm²)
9. 图像-4边细胞计数
10. 图像-5边细胞计数
11. 图像-6边细胞计数
12. 图像-7边细胞计数
13. 图像-8边细胞计数
14. 图像-9边细胞计数
15. 图像-4边细胞面积(µm²)
16. 图像-5边细胞面积(µm²)
17. 图像-6边细胞面积(µm²)
18. 图像-7边细胞面积(µm²)
19. 图像-8边细胞面积(µm²)
20. 图像-9边细胞面积(µm²)
21. 图像-4边细胞面积占比
22. 图像-5边细胞面积占比
23. 图像-6边细胞面积占比
24. 图像-7边细胞面积占比
25. 图像-8边细胞面积占比
26. 图像-9边细胞面积占比
27. 图像-总细胞数
28. 图像-平均六角形细胞规整度
29. 图像-六角形细胞规整度均值标准误(SEM)
30. 图像-多形细胞数量
31. 图像-平均细胞边数
32. 图像-细胞边数均值标准误(SEM)
33. 图像-细胞边数变异系数(CV)
34. 图像-平均形状指数
35. 图像-形状指数均值标准误(SEM)
36. 细胞编号
37. 细胞-细胞面积(µm²)
38. 细胞-细胞边数
39. 细胞-六角形细胞规整度
40. 细胞-形状指数
创建时间:
2017-12-14



