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Oldest Gondwanan non-biting midge (Diptera, Chironomidae, Podonominae) and Gondwana-Laurasia vicariance patterns

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Zenodo2025-09-26 更新2026-05-26 收录
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supporting files for the paper "Oldest Gondwanan non-biting midge (Diptera, Chironomidae, Podonominae) and Gondwana-Laurasia vicariance patterns" structure1) BIOGEOBEARS: code and data (tree.nwk, dispersal multipliers, geography file, distance matrix) for Biogeobears analysis with the full explanation provided in code2)Character Matrices: Geneious prime 4 genes alignment and morphological matrix build in mesquite, undepinning all phylogenetic analyses in the paper3)IQ tree - files produced by the analysis in IQ TREE for morphological and molecular matricies4) BEAST2 - xml file and outputs (logs, trees) for the BEAST2 ancestral divergence analysis 5) Acession numbers of the sequences used

论文《已知最古老的冈瓦纳非摇蚊(双翅目:摇蚊科:棒脉摇蚊亚科)及冈瓦纳-劳亚古陆分替模式》的配套支撑文件。 1) 生物地理分析工具(BioGeoBEARS):用于BioGeoBEARS分析的代码与数据(包括系统树文件tree.nwk、扩散乘数文件、地理数据文件、距离矩阵文件),代码中附有完整说明 2) 特征矩阵:由Geneious Prime生成的4个基因序列比对文件,以及由Mesquite构建的形态学矩阵,支撑了论文中的全部系统发育分析 3) IQ-TREE:针对形态学与分子特征矩阵开展IQ-TREE分析所生成的结果文件 4) BEAST2:用于祖先分化分析的BEAST2 XML配置文件及输出结果(日志文件、系统树文件) 5) 所用序列的登录号

提供机构:
Zenodo
创建时间:
2025-05-21
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