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Table S1. Candidate gene lists for Populus salicinoid phenolic glycosides

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DataONE2018-03-26 更新2024-06-25 收录
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An Excel file of candidate genes from QTL intervals for the salicinoid phenolic glycosides, salicortin and HCH-salicortin in a backcross population of hybrid cottonwoods (Populus fremontii x P. angustifolia. Each worksheet in the file contains the gene lists for a particular interval. In cases where QTL intervals overlapped on the same chromosome, the +/- 1.3Mb interval pertains to the furthest/nearest point from the chromosome start (i.e. co-occurring peaks at 1Mb and 2Mb would have an interval ranging from 0Mb to 3.3Mb). Each table includes gene name, start and end positions in bp, description. QTL peaks from our study, shared SSR makers from Caseys et al. (2015), and candidate genes are all shown in red text.

本数据集为一份Excel文件,包含杂交杨(弗蒙特杨Populus fremontii × 窄叶杨P. angustifolia)回交群体中,与水杨苷类酚苷(salicinoid phenolic glycosides)、柳皮苷(salicortin)及HCH-柳皮苷(HCH-salicortin)相关的数量性状基因座(Quantitative Trait Locus, QTL)区间内的候选基因信息。该文件的每个工作表对应一个特定QTL区间的基因列表。当同一染色体上的QTL区间发生重叠时,±1.3Mb的区间将以染色体起始位置的最远/最近点为基准(例如,在1Mb和2Mb处同时出现峰值的区间,其范围将设定为0Mb至3.3Mb)。每张数据表均包含基因名称、以碱基对(base pair, bp)为单位的起始与终止位置,以及基因功能描述。本研究中的QTL峰值、Caseys等人(2015)共享的简单序列重复(Simple Sequence Repeat, SSR)标记,以及候选基因均以红色字体标注。
创建时间:
2018-03-26
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