Additional file 4: of Small RNA-seq reveals novel regulatory components for apomixis in Paspalum notatum

Lists of miRNA detected in floral samples of sexual and apomictic P. notatum genotypes. Section 1. List of clusters harboring miRNAs detected in four references (P. notatum floral transcriptome, O. sativa genome, S. italica genome, S. bicolor genome) with ShortStack v.3.8.5. Section 2. BLAST SSEARCH of mature miRNAs sequences of P. notatum against MirBase. Section 3. edgeR expression analysis of clusters harbouring miRNAs detected using the above-mentioned four references. (XLSX 51 kb)

本数据集包含在有性生殖与无融合生殖的P. notatum基因型花组织样本中检测到的微小RNA（miRNA）列表。1. 第一部分：基于ShortStack v.3.8.5软件，在四类参考序列（P. notatum花转录组、O. sativa基因组、S. italica基因组、S. bicolor基因组）中鉴定得到的含miRNA的基因簇列表。2. 第二部分：将P. notatum的成熟miRNA序列与miRBase数据库进行BLAST SSEARCH比对的结果。3. 第三部分：基于上述四类参考序列鉴定得到的含miRNA的基因簇的edgeR表达分析结果。本数据集文件格式为XLSX，大小51 kb。