five

Soil chemistry and ITS sequences of permanent forest plots at the Station de biologie des Laurentides

收藏
NIAID Data Ecosystem2026-03-12 收录
下载链接:
https://zenodo.org/record/3631860
下载链接
链接失效反馈
官方服务:
资源简介:
Data of soil chemistry, ITS sequences and plots informations. Target soil fungi using Illumina sequencing with ITS as marker gene. 15 permanent plots of forests dominated by arbuscular mycorrhizal or ectomyoccrhizal trees or both. Located at the Station de Biologie des Laurentides, Université de Montréal.   Files : *fastq.gz contain the sequence data for each samples soil.csv contains soil chemistry and plots informations. label_soil_sample.csv links identifiers for sequencing (i.e. sample) and soil analysis (i.e. sampleID)   Scripts for bioinformatical and statistical analyses can be found here: https://doi.org/10.5281/zenodo.3631982

本数据集包含土壤化学数据、ITS(内转录间隔区,Internal Transcribed Spacer)序列数据以及样地信息。 本研究以ITS作为标记基因,采用Illumina测序技术对目标土壤真菌进行测序分析。 共设置15处永久性森林样地,样地优势树种为丛枝菌根(arbuscular mycorrhizal)树木、外生菌根(ectomycorrhizal)树木,或二者兼有。 样地位于蒙特利尔大学劳伦茨生物学站(Station de Biologie des Laurentides, Université de Montréal)。 数据集文件: * fastq.gz格式文件存储了所有样本的序列数据 * soil.csv文件包含土壤化学数据与样地信息 * label_soil_sample.csv文件用于关联测序样本标识符与土壤分析样本标识符(sampleID) 用于生物信息学与统计学分析的脚本可通过以下链接获取:https://doi.org/10.5281/zenodo.3631982
创建时间:
2021-04-21
二维码
社区交流群
二维码
科研交流群
商业服务