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Additional file 1 of A chromosome-scale assembly of the smallest Dothideomycete genome reveals a unique genome compaction mechanism in filamentous fungi

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Mendeley Data2024-06-25 更新2024-06-27 收录
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Additional file 1: Table S1. Genes in subtelomeric regions. ‘L’ means the left end of chromosomes. ‘R’ means the right end of chromosomes. Table S2. The annotations of collinear genes. Table S3. Repeat content in Peltaster fructicola. Table S4. Cluster containing unique gene in Peltaster fructicola but multi-genes in Zymoseptoria tritici. Table S5. Genes involved in carbohydrate metabolism. Table S6. Genes involved in amino acid metabolism. Table S7. Genes involved in nucleotide metabolism. Table S8. Genes involved in lipid metabolism. Table S9. Genes involved in cofactor metabolism. Table S10. Strain number and download source of selected species for phylogenomics. Table S11. Sequence Read Archive (SRA) accession number lists.

附加文件1:表S1。亚端粒区域基因。其中“L”代表染色体左臂,“R”代表染色体右臂。 表S2。共线性基因注释表。 表S3。果座双孢菌(Peltaster fructicola)的重复序列组成。 表S4。仅在果座双孢菌(Peltaster fructicola)中存在独有单拷贝基因、而在小麦颖枯病菌(Zymoseptoria tritici)中存在多拷贝基因的基因簇。 表S5。参与碳水化合物代谢的基因。 表S6。参与氨基酸代谢的基因。 表S7。参与核苷酸代谢的基因。 表S8。参与脂质代谢的基因。 表S9。参与辅因子代谢的基因。 表S10。系统发育基因组学所选物种的菌株编号及下载来源。 表S11。序列读取存档(Sequence Read Archive, SRA)登录号列表。
创建时间:
2023-06-28
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