Simulation POPC_512_WALP23_10_5up_5down_NaCl_150mM_310K membrane

<strong>Title publication: </strong><em>A Ceramide-Regulated Element in the Late Endosomal Protein LAPTM4B Controls Amino Acid Transporter Interaction</em> <strong><strong>Year publication:</strong></strong><strong> </strong>2018 <strong>DOI publication: </strong>10.1021/acscentsci.7b00582 <strong>Description:</strong> Simulation POPC membrane containing ten WALP23 peptides ausing charmm36 at 310K. <strong>MD engine:</strong> gromacs 5.0.4 <strong>Force field</strong>: charmm36 <strong>Temperature</strong>: 310 K <strong>Pressure:</strong> 1 bar <strong>Simulation time</strong>: 2000 ns <strong>Saving frequency</strong>: 100 ps <strong>Molecular content</strong>: WALP23 10<br> POPC 512<br> SOL 20480<br> NA 55<br> CL 55 <strong>Additional </strong><strong>information</strong>:<br> * Membrane containing WALP23 peptides (Ac-GWWLALALALALALALALALWWA-NH2).已发表论文标题：《晚期内体蛋白LAPTM4B中的神经酰胺调控元件调控氨基酸转运蛋白相互作用》 发表年份：2018年 发表DOI：10.1021/acscentsci.7b00582 数据集描述：使用CHARMM36力场，在310K条件下开展含10条WALP23肽的POPC（1-棕榈酰-2-油酰-sn-甘油-3-磷酸胆碱）膜体系的分子动力学模拟 分子动力学模拟引擎：GROMACS 5.0.4 力场：CHARMM36 温度：310开尔文（K） 压力：1巴 模拟时长：2000纳秒（ns） 数据保存频率：100皮秒（ps） 体系分子组成： WALP23肽：10条 POPC（1-棕榈酰-2-油酰-sn-甘油-3-磷酸胆碱）：512个 溶剂分子（SOL）：20480个 钠离子（Na⁺）：55个 氯离子（Cl⁻）：55个 附加信息： * 含WALP23肽（序列为Ac-GWWLALALALALALALALALWWA-NH2）的膜体系