Drosophila willistoni (dwil_caf1 August 2006)

High confidence set 284 tRNAs decoding standard 20 AA 284 Selenocysteine tRNAs (TCA) 0 Notable atypical predictions Anticodon/isotype mismatch 2 Other tRNA-like predictions Primary filter (tRNAscan-SE pseudogenes) 5 Secondary filter (low feature scores, possible rep. element) 15 Leu CAA 6 Ile TAT 4 Tyr GTA 9 Isotype tRNA Count by Anticodon Total Ala AGC 11 GGC CGC 2 TGC 5 18 Gly ACC GCC 12 CCC TCC 6 18 Pro AGG 7 GGG CGG 4 TGG 5 16 Thr AGT 7 GGT CGT 4 TGT 6 17 Val AAC 8 GAC CAC 5 TAC 4 17 Isotype tRNA Count by Anticodon Total Ser AGA 6 GGA CGA 3 TGA 2 ACT GCT 5 16 Arg ACG 10 GCG CCG TCG 6 CCT 4 TCT 3 23 Leu AAG 4 GAG CAG 8 TAG 2 CAA 6 TAA 2 22 Isotype tRNA Count by Anticodon Total Phe AAA GAA 6 6 Asn ATT GTT 9 9 Lys CTT 10 TTT 7 17 Asp ATC GTC 15 15 Glu CTC 12 TTC 9 21 His ATG GTG 7 7 Gln CTG 6 TTG 4 10 Isotype tRNA Count by Anticodon Total Ile AAT 9 GAT CAT TAT 4 13 iMet/Met CAT 6/8 14 Tyr ATA GTA 9 9 Supres TCA CTA TTA 0 Cys ACA GCA 10 10 Trp CCA 6 6 SelCys TCA 0

本高置信度数据集包含284条解码标准20种氨基酸的转运RNA（transfer RNA, tRNA），以及0条硒半胱氨酸转运RNA（Selenocysteine tRNA, TCA）。值得关注的非典型预测结果包括：反密码子/亚型错配2条、其他类tRNA预测结果。一级过滤（tRNAscan-SE 假基因）共筛除5条序列；二级过滤（特征分数较低，可能为重复元件）共筛除15条序列。亮氨酸（Leu）CAA型6条、异亮氨酸（Ile）TAT型4条、酪氨酸（Tyr）GTA型9条。

按反密码子分类的亚型tRNA计数总计：
1. 丙氨酸（Ala）：反密码子AGC 11条、GGC、CGC 2条、TGC 5条，总计18条
2. 甘氨酸（Gly）：反密码子ACC 12条、CCC、TCC 6条，总计18条
3. 脯氨酸（Pro）：反密码子AGG 7条、GGG、CGG 4条、TGG 5条，总计16条
4. 苏氨酸（Thr）：反密码子AGT 7条、GGT、CGT 4条、TGT 6条，总计17条
5. 缬氨酸（Val）：反密码子AAC 8条、GAC、CAC 5条、TAC 4条，总计17条

按反密码子分类的亚型tRNA计数总计：
1. 丝氨酸（Ser）：反密码子AGA 6条、GGA、CGA 3条、TGA 2条、ACT、GCT 5条，总计16条
2. 精氨酸（Arg）：反密码子ACG 10条、GCG、CCG、TCG 6条、CCT 4条、TCT 3条，总计23条
3. 亮氨酸（Leu）：反密码子AAG 4条、GAG、CAG 8条、TAG 2条、CAA 6条、TAA 2条，总计22条

按反密码子分类的亚型tRNA计数总计：
1. 苯丙氨酸（Phe）：反密码子AAA、GAA各6条，总计12条
2. 天冬酰胺（Asn）：反密码子ATT、GTT各9条，总计18条
3. 赖氨酸（Lys）：反密码子CTT 10条、TTT 7条，总计17条
4. 天冬氨酸（Asp）：反密码子ATC、GTC各15条，总计30条
5. 谷氨酸（Glu）：反密码子CTC 12条、TTC 9条，总计21条
6. 组氨酸（His）：反密码子ATG、GTG各7条，总计14条
7. 谷氨酰胺（Gln）：反密码子CTG 6条、TTG 4条，总计10条

按反密码子分类的亚型tRNA计数总计：
1. 异亮氨酸（Ile）：反密码子AAT 9条、GAT、CAT、TAT 4条，总计13条
2. 起始/抑制型Met（iMet/Met）：CAT型6/8条，总计14条
3. 酪氨酸（Tyr）：反密码子ATA、GTA各9条，总计18条

抑制型tRNA：TCA、CTA、TTA型均为0条
半胱氨酸（Cys）：反密码子ACA、GCA各10条，总计20条
色氨酸（Trp）：反密码子CCA 6条，总计6条
硒半胱氨酸tRNA（SelCys）：TCA型0条