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Alliance of Genome Resources Molecular Interactions

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NIAID Data Ecosystem2026-05-01 收录
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https://zenodo.org/record/8204630
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This file provides a set of annotations of molecular interactions for genes and gene products for human, rat, mouse, zebrafish, fruit fly, nematode, yeast, African and Western clawed frogs, and SARS-CoV-2. The file is in the PSI-MI TAB 2.7 format, a tab-delimited format established by the HUPO Proteomics Standards Initiative Molecular Interactions (PSI-MI) working group. The interaction data is sourced from Alliance members WormBase and FlyBase, as well as the IMEx consortium and the BioGRID database. The file contains molecular interaction annotations for the following organisms: Homo sapiens (human; NCBI:txid 9606) Caenorhabditis elegans (nematode; NCBI:txid 6239) Danio rerio (zebrafish;NCBI:txid 7955) Drosophila melanogaster (fruit fly; NCBI:txid 7227) Mus musculus (mouse; NCBI:txid10090) Rattus norvegicus (rat; NCBI:txid 10116) Saccharomyces cerevisiae (yeast; NCBI:txid 559292) Xenopus laevis (African clawed frog; NCBI:txid 8355) Xenopus tropicalis (Western clawed frog; NCBI:txid 8364) Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2; NCBI:txid2697049)

本文件提供了覆盖人类、大鼠、小鼠、斑马鱼、果蝇、线虫、酵母、非洲爪蟾、西部爪蟾以及严重急性呼吸综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)的基因及其编码产物的分子相互作用注释集。本文件采用PSI-MI TAB 2.7格式,该格式为由人类蛋白质组组织(HUPO)蛋白质组学标准倡议分子相互作用(PSI-MI)工作组制定的制表符分隔格式。本交互数据集的来源包括联盟成员WormBase、FlyBase,以及IMEx联盟与BioGRID数据库。 本文件包含以下物种的分子相互作用注释: Homo sapiens(智人,人类;NCBI:txid 9606) Caenorhabditis elegans(秀丽隐杆线虫,线虫;NCBI:txid 6239) Danio rerio(斑马鱼;NCBI:txid 7955) Drosophila melanogaster(黑腹果蝇,果蝇;NCBI:txid 7227) Mus musculus(小家鼠,小鼠;NCBI:txid 10090) Rattus norvegicus(褐家鼠,大鼠;NCBI:txid 10116) Saccharomyces cerevisiae(酿酒酵母,酵母;NCBI:txid 559292) Xenopus laevis(非洲爪蟾;NCBI:txid 8355) Xenopus tropicalis(热带爪蟾,西部爪蟾;NCBI:txid 8364) Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2(严重急性呼吸综合征冠状病毒2,SARS-CoV-2;NCBI:txid 2697049)
创建时间:
2023-08-03
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