NAMD Simulation of Pure POPC Membranes with CHARMM36 Force Field
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资源简介：
System: POPC membrane with 72 (36 x 36) lipids
Number of POPC: 72
Number of Waters: 2520
Water model: TIP3P [WL Jorgensen, J Chandrasekhar, JD Madura, RW Impey, ML Klein J. Chem. Phys. 79 926 (1983)].
Force Field: CHARMM36
Simulation engine: NAMD Git-2020-02-27 for Linux-x86_64-multicore-CUDA [Phillips et al., J. Comp. Chem. 26:1781-1802 (2005)]
Number of independent repeats per setup: 1.
Trajectory lengths per repeat: 100 ns.
Previously equilibrated for: 0 ns.
Sampling rate: every 100 ps.
Time integration step: 2 fs. (For further info, please see the .inp file)
体系：含72（36×36）个脂质的1-棕榈酰-2-油酰-sn-甘油-3-磷酸胆碱（POPC）膜
POPC数目：72
水分子数目：2520
水模型：TIP3P [WL Jorgensen、J Chandrasekhar、JD Madura、RW Impey、ML Klein，《化学物理学杂志》，79卷，926页，1983年]
力场：CHARMM36
模拟引擎：适用于Linux-x86_64多核心CUDA架构的NAMD Git-2020-02-27版本 [Phillips等人，《计算化学杂志》，26卷，1781-1802页，2005年]
每组设置的独立重复次数：1次
单次重复的轨迹时长：100纳秒（ns）
预平衡时长：0纳秒
采样频率：每100皮秒（ps）一次
时间积分步长：2飞秒（fs）。（更多信息请查看.inp文件）
创建时间：
2022-08-01
