staahl2016visualization_ST_MOB

staahl2017visualization_ST_MOB are spatial transcriptomics datasets of mouse olfactory bulb and human breast cancer, published with the paper presenting spatial transcriptomics (ST) technology. It was generated by ST, that allows visualization and quantitative analysis of the transcriptome with spatial resolution in individual tissue sections. staahl2017visualization_ST_MOB and staahl2016visualization_ST_BreastCancer_Layer are the most widely used benchmark datasets among SE methods, including SPRI64, SpaGCN45, GPcounts65, sepal66, SPARK36, trendseek35 and SpatialDE34. The staahl2017visualization_ST_MOB dataset contains 12 sub-datasets with ~16000 genes expression features, and the number of spots for the 12 replicates are 267 (Rep1), 280 (Rep2), 269 (Rep3), 264 (Rep4), 267 (Rep5), 242 (Rep6), 231 (Rep7), 234 (Rep8), 237 (Rep9), 281 (Rep10), 262 (Rep11) and 282 (Rep12).The datasets was downloaded from https://www.spatialresearch.org/resources-published-datasets/, containing H&E images, spot-wise region annotation and count matrix of each sub-dataset, as well as other spatial transcriptomics resource published datasets.

staahl2017visualization_ST_MOB 是针对小鼠嗅球与人类乳腺癌的空间转录组学（spatial transcriptomics）数据集，与介绍空间转录组（ST）技术的学术论文同步发表。该数据集由ST技术生成，可在单个组织切片中实现空间分辨率下的转录组可视化与定量分析。
staahl2017visualization_ST_MOB 与 staahl2016visualization_ST_BreastCancer_Layer 是空间富集分析（SE）方法领域内应用最广泛的基准数据集，涉及的分析方法包括SPRI64、SpaGCN45、GPcounts65、sepal66、SPARK36、trendseek35 以及 SpatialDE34。
staahl2017visualization_ST_MOB 数据集包含12个子数据集，涵盖约16000个基因表达特征；12个重复样本的测序位点（spot）数量分别为267（Rep1）、280（Rep2）、269（Rep3）、264（Rep4）、267（Rep5）、242（Rep6）、231（Rep7）、234（Rep8）、237（Rep9）、281（Rep10）、262（Rep11）以及282（Rep12）。
该类数据集下载自https://www.spatialresearch.org/resources-published-datasets/，每个子数据集均包含苏木精-伊红（H&E）染色图像、位点级区域注释信息与基因计数矩阵，该平台同时收录了其他已发表的空间转录组学相关资源数据集。