Phylogenetic Reconstruction
收藏DataCite Commons2022-07-28 更新2024-07-29 收录
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https://figshare.com/articles/dataset/Phylogenetic_Reconstruction/16855939
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资源简介：
Alignments and output phylogenies for phylogenetic reconstruction of 177 species dataset<br>trimmed_orthogroups.tar.xz - alignments for individual gene families<br>concatenated_alignment.phy - concatenation of gene family alignments<br>177_taxa_ASTRAL.newick.txt - ASTRAL multispecies coalescent tree from 177 gene families<br>177_taxa_ML.newick.txt - Maximum Likelihood (LG+C60+G4+F) phylogeny of concatenated alignment<br><br>177_taxa_BI_CATGTR.newick.txt - Bayesian Inference phylogeny estimated under the CAT+GTR model<br>
本数据集涵盖用于177个物种种系发育重建的序列联配与产出的各类系统发育树文件：
trimmed_orthogroups.tar.xz：单基因家族的序列联配文件包
concatenated_alignment.phy：基因家族联配的串联序列文件
177_taxa_ASTRAL.newick.txt：基于177个基因家族得到的ASTRAL多物种溯祖树（multispecies coalescent tree）
177_taxa_ML.newick.txt：基于串联序列文件构建的最大似然（Maximum Likelihood，LG+C60+G4+F）系统发育树
177_taxa_BI_CATGTR.newick.txt：基于CAT+GTR模型估算得到的贝叶斯推断（Bayesian Inference）系统发育树
提供机构：
figshare
创建时间：
2022-07-28
