raisd-ai_evaluation_dataset_old_migration_10K
收藏DataCite Commons2024-12-25 更新2025-01-06 收录
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Dataset with old migration used for the evaluation of RAiSD-AI software.The commands to generate MS files are:train/neutral.ms: ./msdir/ms 128 10000 -I 2 0 128 0.0 -en 0 2 0.05 -em 0 2 1 3 -t 2000 -r 2000 2000 -ej 3 1 2 -en 3 2 118085 44678 25766train/selsweep.ms: ./msseldir/mssel 128 10000 0 128 ./trajectory_files/trajectory_continent_island.txt 1000 -I 2 0 0 0 128 0.0 -en 0 2 0.05 -em 0 2 1 3 -t 2000 -r 2000 2000 -ej 3 1 2 -en 3 2 1 18085 44678 25766test/neutral.ms: ./msdir/ms 128 1000 -I 2 0 128 0.0 -en 0 2 0.05 -em 0 2 1 3 -t 2000 -r 2000 2000 -ej 3 1 2 -en 3 2 1 3246 30505 54857test/selsweep.ms: ./msseldir/mssel 128 1000 0 128 ./trajectory_files/trajectory_continent_island.txt 1000 -I 2 0 0 0 128 0.0 -en 0 2 0.05 -em 0 2 1 3 -t 2000 -r 2000 2000 -ej 3 1 2 -en 3 2 1 59251 42000 59295
本数据集基于旧版迁徙模型构建，用于RAiSD-AI软件的性能评估。以下为生成各MS文件的命令：
1. 训练集中性进化数据集的MS文件生成命令：`./msdir/ms 128 10000 -I 2 0 128 0.0 -en 0 2 0.05 -em 0 2 1 3 -t 2000 -r 2000 2000 -ej 3 1 2 -en 3 2 118085 44678 25766`
2. 训练集选择扫荡数据集的MS文件生成命令：`./msseldir/mssel 128 10000 0 128 ./trajectory_files/trajectory_continent_island.txt 1000 -I 2 0 0 0 128 0.0 -en 0 2 0.05 -em 0 2 1 3 -t 2000 -r 2000 2000 -ej 3 1 2 -en 3 2 1 18085 44678 25766`
3. 测试集中性进化数据集的MS文件生成命令：`./msdir/ms 128 1000 -I 2 0 128 0.0 -en 0 2 0.05 -em 0 2 1 3 -t 2000 -r 2000 2000 -ej 3 1 2 -en 3 2 1 3246 30505 54857`
4. 测试集选择扫荡数据集的MS文件生成命令：`./msseldir/mssel 128 1000 0 128 ./trajectory_files/trajectory_continent_island.txt 1000 -I 2 0 0 0 128 0.0 -en 0 2 0.05 -em 0 2 1 3 -t 2000 -r 2000 2000 -ej 3 1 2 -en 3 2 1 59251 42000 59295`
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创建时间：
2024-11-26
