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OpenSeizureDatabase|癫痫检测数据集|医疗研究数据集

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github2024-05-19 更新2024-05-31 收录
癫痫检测
医疗研究
下载链接:
https://github.com/OpenSeizureDetector/OpenSeizureDatabase
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资源简介:
本数据库包含由OpenSeizureDetector用户贡献的癫痫发作及类似数据,旨在为改进癫痫检测算法的研究做出贡献。
创建时间:
2022-08-13
原始信息汇总

OpenSeizureDatabase 数据集概述

数据集描述

OpenSeizureDatabase 是一个包含癫痫发作和类似癫痫发作数据的数据库,这些数据由 OpenSeizureDetector 用户贡献,旨在改进癫痫检测算法(Open Seizure Toolkit, OSTK)。该数据库数据存储在单独的位置,访问需申请。

许可证

  • 数据集的许可证是 Creative Commons Share Alike 许可证的变体,要求使用数据开发的系统描述和结果必须公开发布,以造福 OpenSeizureDetector 项目的用户。

数据用户

以下研究人员已获得匿名化 OpenSeizureDatabase 数据的访问权限:

姓名 联系方式 研究领域 网站
Graham Jones graham@openseizuredetector.org.uk 改进 OpenSeizureDetector 的癫痫检测算法开发 OpenSeizureDetector
Jamie Pordoy pordjam@uwl.ac.uk 癫痫检测的博士研究 IntSaV Group
Benjamin Mickler 癫痫检测研究
Anthony Cuturrufo, UCLA 机器学习癫痫检测
Bram Regtien @aroonPro OSD 开发
Jongchan Lee, Mokwon University @paorisun 多功能智能手表开发的学生项目
Junrun Chen, Hangzhou Dianzi University @ErHai1 癫痫发作类型分类和癫痫分类检测

希望访问数据的研究人员应通过电子邮件 osdb@openseizuredetector.org.uk 申请,并说明数据使用意图及遵守许可证要求的承诺。

安装说明

  1. 在主目录中创建名为 "osd" 的文件夹并进入该目录。
  2. 克隆此仓库(git clone https://github.com/OpenSeizureDetector/OpenSeizureDatabase.git)。
  3. 进入 ~/osd/OpenSeizureDatabase 目录。
  4. 创建 Python 虚拟环境(python -m venv ~/pyEnvs/osdb)。
  5. 激活虚拟环境(source ~/pyEnvs/osdb/bin/activate)。
  6. 执行 pip install -r requirements.txt 安装依赖(可选删除 tensorflow 依赖)。
  7. 在主目录中创建名为 "osd/osdb" 的文件夹。
  8. 将 OSDB JSON 文本文件复制到 ~/osd/osdb 目录。

测试安装

  1. 进入 ~osd/OpenSeizureDatabase/user_tools/dataSummariser 目录。
  2. 将 osdbCfg.json.template 重命名为 osdbCfg.json 并根据配置进行调整。
  3. 执行 python ./summariseData.py --index,生成包含数据库所有数据的 output/index.html 文件。
  4. 执行 python ./summariseData.py --event=5483,生成包含事件摘要的 output/Event_5483_summary 文件夹。

文档

有关数据结构和软件的详细信息,请参阅 Documentation。 示例数据集可在 documentation 文件夹中找到。

AI搜集汇总
数据集介绍
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构建方式
OpenSeizureDatabase数据集的构建依托于OpenSeizureDetector用户的贡献,旨在为癫痫发作及类似事件的研究提供数据支持。该数据集通过收集用户的癫痫发作数据,并将其整理为JSON格式文件,以便于后续的算法研究和开发。数据集的构建过程严格遵循匿名化处理,确保用户隐私得到充分保护。
特点
OpenSeizureDatabase数据集的核心特点在于其多样性和开放性。数据涵盖了多种癫痫发作类型,且由全球多个研究团队和用户共同贡献,确保了数据的广泛性和代表性。此外,数据集采用JSON格式存储,便于研究人员快速处理和分析,同时提供了丰富的工具包,支持用户对数据进行深入探索。
使用方法
使用OpenSeizureDatabase数据集时,用户需先通过电子邮件申请访问权限,并承诺遵守数据使用许可协议。获得权限后,用户可通过GitHub仓库下载数据,并使用提供的Python工具包进行数据处理和分析。工具包包括数据汇总、事件摘要生成等功能,帮助用户快速上手并深入研究癫痫发作检测算法。
背景与挑战
背景概述
OpenSeizureDatabase(OSDB)是由OpenSeizureDetector项目的用户贡献的癫痫发作及类似发作数据的数据库,旨在推动癫痫检测算法的研究与改进。该数据集由Graham Jones等人创建,主要研究人员包括来自不同机构和大学的学者,如University of West London的Jamie Pordoy和UCLA的Anthony Cuturrufo等。OSDB的核心研究问题在于通过提供高质量的癫痫发作数据,帮助研究人员开发更精确的癫痫检测算法,从而提升癫痫患者的监测与管理水平。该数据集的创建不仅为癫痫检测领域提供了宝贵的资源,还促进了跨学科的合作与研究。
当前挑战
OpenSeizureDatabase在构建和应用过程中面临多项挑战。首先,数据收集的复杂性在于确保数据的准确性和代表性,尤其是癫痫发作数据的多样性和不规则性。其次,数据隐私和安全问题也是一大挑战,需确保患者数据的匿名化处理,以符合伦理和法律要求。此外,数据的标准化和格式统一性问题,尤其是在多源数据整合时,增加了数据处理的难度。最后,如何有效利用这些数据进行算法训练和验证,以提升癫痫检测的准确性和实时性,也是当前研究中的重要挑战。
常用场景
经典使用场景
OpenSeizureDatabase数据集在癫痫检测算法的研究中扮演着至关重要的角色。研究者们利用该数据集中的癫痫发作及类似事件的数据,通过构建和优化检测算法,旨在提高癫痫发作的实时检测精度。这些算法不仅能够帮助医生更早地识别癫痫发作,还能为患者提供及时的医疗干预,从而显著提升生活质量。
实际应用
在实际应用中,OpenSeizureDatabase数据集被广泛用于开发智能医疗设备,如智能手表和便携式监测设备,这些设备能够实时监测患者的生理数据并及时预警癫痫发作。此外,该数据集还支持了多个临床研究项目,帮助医生优化治疗方案,提高患者的治疗效果和生活质量。
衍生相关工作
基于OpenSeizureDatabase数据集,研究者们开发了多种癫痫检测算法和模型,包括基于机器学习的分类器和深度学习网络。这些工作不仅提升了癫痫检测的准确性,还推动了相关领域的技术进步,如智能穿戴设备的算法优化和实时数据处理技术的提升。
以上内容由AI搜集并总结生成
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