CHAF LD values
收藏DataCite Commons2025-11-20 更新2026-02-09 收录
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https://figshare.com/articles/dataset/CHAF_LD_values/29425265/2
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D', r<sup>2</sup>, and partial correlation values for the CHAF hybrid population. Files beginning with "mt1_results" are the LD values for each AIM in the population. Files with "avgd-prime" average these individual LD values (for D' and r<sup>2</sup>) for any AIMs belonging to the same gene. Similarly, files with "avgpcor" contain gene-averaged partial correlation values. <br>directnmt indicates AIMs/genes identified as interacting n-mts in the mansucriptindirectnmt indicates AIMs/genes identified as non-interacting n-mtsnonnmt indicates AIMs/genes idenfiied as non-n-mts
本数据集涵盖CHAF杂交群体的连锁不平衡系数D'、r²以及偏相关系数。以"mt1_results"为前缀的文件,存储了该群体中每个祖先信息标记(Ancestry Informative Marker)的连锁不平衡(Linkage Disequilibrium)值。带有"avgd-prime"字样的文件,对隶属于同一基因的所有祖先信息标记的个体连锁不平衡值(即D'与r²)进行了平均计算。类似地,带有"avgpcor"字样的文件,则存储了经基因水平平均后的偏相关系数值。
其中,directnmt用于标识本文手稿中被认定为与核线粒体序列(n-mts)存在相互作用的祖先信息标记/基因;indirectnmt用于标识被认定为与n-mts无相互作用的祖先信息标记/基因;nonnmt用于标识被认定为非n-mts相关的祖先信息标记/基因。
提供机构:
figshare
创建时间:
2025-11-20



