PDBbind v.2013 core set manually curated
收藏Figshare2023-12-13 更新2026-04-08 收录
下载链接：
https://figshare.com/articles/dataset/PDBbind_v_2013_core_set_manually_curated/24802788/1
下载链接
链接失效反馈官方服务：
资源简介：
PDBbind v.2013 core set manually curated to optimize the hydrogen bond network considering protein and ligand protonation states.The description of this dataset preparation is published in the following reference:Guedes, I. A.; Barreto, A. M. S.; Marinho, D.; Krempser, E.; Kuenemann, M. A.; Sperandio, O.; Dardenne, L. E.; Miteva, M. A. New Machine Learning and Physics-Based Scoring Functions for Drug Discovery. <i>Sci Rep</i> <b>2021</b>, <i>11</i> (1), 3198. https://doi.org/10.1038/s41598-021-82410-1.
PDBbind v.2013核心集经人工整理优化，在考量蛋白质与配体质子化状态的前提下对其氢键网络进行了优化。该数据集的制备方法已发表于以下参考文献：Guedes, I. A.; Barreto, A. M. S.; Marinho, D.; Krempser, E.; Kuenemann, M. A.; Sperandio, O.; Dardenne, L. E.; Miteva, M. A. 用于药物发现的新型机器学习与基于物理的评分函数。《科学报告（Sci Rep）》，2021年，第11卷，第1期，第3198页。https://doi.org/10.1038/s41598-021-82410-1.
提供机构：
Grupo de Modelagem Molecular em Sistemas Biológicos, GMMSB
创建时间：
2023-12-13
