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CD34+ human bone marrow

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NIAID Data Ecosystem2026-03-13 收录
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https://figshare.com/articles/dataset/CD34_human_bone_marrow/20043191
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资源简介:
scRNA-seq dataset early human hematopoiesis (CD34+ bone marrow cells) assayed using 10x chromium. Total cell number is 5,780. This dataset contains raw spliced and unspliced counts estimated using the velocyto pipeline (La Manno et al., Nature 2018) that can be used to compute RNA velocity. Further, the dataset contains a precomputed Palantir pseudotime (Setty et al., Nature Biotechnology 2019). Please cite the original publication: https://doi.org/10.1038/s41587-019-0068-4

本数据集为采用10x Chromium平台检测的人类早期造血单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)数据,样本为CD34阳性骨髓细胞,总细胞数为5780个。 本数据集包含通过velocyto分析流程(La Manno等,《Nature》,2018)估算得到的原始剪接计数与未剪接计数,可用于计算RNA速率(RNA velocity)。此外,该数据集还包含预先计算完成的Palantir拟时间(Palantir pseudotime,Setty等,《Nature Biotechnology》,2019)。 请引用原始文献:https://doi.org/10.1038/s41587-019-0068-4
创建时间:
2022-06-09
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