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Additional file 2 of A network of transcription factors in complex with a regulating cell cycle cyclin orchestrates fungal oxidative stress responses

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Figshare2024-08-18 更新2026-04-08 收录
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Additional file2: Table S1. Primers used in this study. (xlsx). Table S2. DEGs of ΔBbOsrR1 versus WT under normal condition (¼ SDY). (xlsx). Table S3. DEGs of ΔBbOsrR1 versus WT under H2O2 (4 mM)-stress condition for 30 min. (xlsx). Table S4. DEGs of ΔBbClp1 versus WT under normal condition (¼ SDY). (xlsx). Table S5. DEGs of ΔBbClp1 versus WT under H2O2 (4 mM)-stress condition for 30 min. (xlsx). Table S6. DEGs of ΔBbClp1 versus WT under menadione (60 μM)-stress condition for 30 min. (xlsx). Table S7. DEGs of ΔBbOsrR2 versus WT under normal condition (¼ SDY). (xlsx). Table S8. DEGs of ΔBbOsrR2 versus WT under H2O2 (4 mM)-stress condition for 30 min. (xlsx). Table S9. DEGs of ΔBbOsrR2 versus WT under menadione (60 μM)-stress condition for 30 min. (xlsx). Table S10. DEGs of ΔBbOsrR3 versus WT under normal condition (¼ SDY). (xlsx). Table S11. DEGs of ΔBbOsrR3 versus WT under H2O2 (4 mM)-stress condition for 30 min. (xlsx). Table S12. DEGs of ΔBbOsrR3 versus WT under menadione (60 μM)-stress condition for 30 min. (xlsx). Table S13. BbOsrR1 target genes identified by ChIP-seq under normal condition. (xlsx). Table S14. BbOsrR1 target genes identified by ChIP-seq under H2O2 (4 mM)-stress condition for 30 min. (xlsx). Table S15. BbOsrR2 target genes identified by ChIP-seq under normal condition.. Table S16. BbOsrR2 target genes identified by ChIP-seq under H2O2 (4 mM)-stress condition for 30 min. (xlsx). Table S17. BbOsrR2 target genes identified by ChIP-seq under menadione (60 μM)-stress condition for 30 min. (xlsx). Table S18. BbOsrR3 target genes identified by ChIP-seq under normal condition. (xlsx). Table S19. BbOsrR3 target genes identified by ChIP-seq under H2O2 (4 mM)-stress condition for 30 min. (xlsx). Table S20. BbOsrR3 target genes identified by ChIP-seq under menadione (60 μM)-stress condition for 30 min. (xlsx)

附加文件2:表S1 本研究中使用的引物(xlsx格式)。表S2 正常培养条件(¼ SDY)下,ΔBbOsrR1与野生型(Wild Type,WT)的差异表达基因(Differentially Expressed Genes,DEGs)(xlsx格式)。表S3 经4 mM过氧化氢胁迫处理30分钟后,ΔBbOsrR1与野生型(WT)的差异表达基因(DEGs)(xlsx格式)。表S4 正常培养条件(¼ SDY)下,ΔBbClp1与野生型(WT)的差异表达基因(DEGs)(xlsx格式)。表S5 经4 mM过氧化氢胁迫处理30分钟后,ΔBbClp1与野生型(WT)的差异表达基因(DEGs)(xlsx格式)。表S6 经60 μM甲萘醌(menadione)胁迫处理30分钟后,ΔBbClp1与野生型(WT)的差异表达基因(DEGs)(xlsx格式)。表S7 正常培养条件(¼ SDY)下,ΔBbOsrR2与野生型(WT)的差异表达基因(DEGs)(xlsx格式)。表S8 经4 mM过氧化氢胁迫处理30分钟后,ΔBbOsrR2与野生型(WT)的差异表达基因(DEGs)(xlsx格式)。表S9 经60 μM甲萘醌胁迫处理30分钟后,ΔBbOsrR2与野生型(WT)的差异表达基因(DEGs)(xlsx格式)。表S10 正常培养条件(¼ SDY)下,ΔBbOsrR3与野生型(WT)的差异表达基因(DEGs)(xlsx格式)。表S11 经4 mM过氧化氢胁迫处理30分钟后,ΔBbOsrR3与野生型(WT)的差异表达基因(DEGs)(xlsx格式)。表S12 经60 μM甲萘醌胁迫处理30分钟后,ΔBbOsrR3与野生型(WT)的差异表达基因(DEGs)(xlsx格式)。表S13 正常培养条件下,通过染色质免疫共沉淀测序(Chromatin Immunoprecipitation sequencing,ChIP-seq)鉴定得到的BbOsrR1靶基因(xlsx格式)。表S14 经4 mM过氧化氢胁迫处理30分钟后,通过ChIP-seq鉴定得到的BbOsrR1靶基因(xlsx格式)。表S15 正常培养条件下,通过ChIP-seq鉴定得到的BbOsrR2靶基因(xlsx格式)。表S16 经4 mM过氧化氢胁迫处理30分钟后,通过ChIP-seq鉴定得到的BbOsrR2靶基因(xlsx格式)。表S17 经60 μM甲萘醌胁迫处理30分钟后,通过ChIP-seq鉴定得到的BbOsrR2靶基因(xlsx格式)。表S18 正常培养条件下,通过ChIP-seq鉴定得到的BbOsrR3靶基因(xlsx格式)。表S19 经4 mM过氧化氢胁迫处理30分钟后,通过ChIP-seq鉴定得到的BbOsrR3靶基因(xlsx格式)。表S20 经60 μM甲萘醌胁迫处理30分钟后,通过ChIP-seq鉴定得到的BbOsrR3靶基因(xlsx格式)
提供机构:
Zhao, Xin; Zeng, Fanqin; Keyhani, Nemat O.; Li, Min; Kan, Yanze; Huang, Shuaishuai; Luo, Zhibing; He, Zhangjiang; Liu, Pengfei; Zhang, Yongjun; Li, Ning
创建时间:
2024-08-15
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