TL2 14028s invA::cam IP BALBc mouse LibS invA vs Lib0 invA Mice. Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium

Salmonella typhimurium 14028s invA::cam Transposon library recovered from spleen 2 days after IP passage of 2.2 x 10^6 through BALB/c mouse, compared to the initial Transposon library grown in LB broth (kanamycin 50ug/ml), O/N at 37°C with aeration Keywords: Transposon tag analysis Overall design: 6 biological replicates analysed after arbitrarily primed sampling (Klenow, DOPR degenerate primer) + specific PCR amplification (Taq DNA Pol) + T7 in vitro transcription (AmpliScribe T7) + RT labeling (Cy3) + hybridization, compared to identically processed standard library (Cy5)

本数据集为鼠伤寒沙门氏菌（Salmonella typhimurium）14028s invA::cam转座子文库（Transposon library）的体内外比较分析数据：将2.2×10^6个该转座子文库通过BALB/c小鼠腹腔注射传代，2天后回收其脾脏中的文库样本，与初始在LB肉汤培养基（LB broth，含50μg/ml卡那霉素（kanamycin））中37℃通气过夜培养的转座子文库进行对照比较。关键词：转座子标签分析（Transposon tag analysis）。实验设计：对6个生物学重复样本依次开展任意引物取样（使用克列诺酶（Klenow）与DOPR简并引物）、特异性PCR扩增（使用Taq DNA聚合酶（Taq DNA Pol））、T7体外转录（使用AmpliScribe T7转录试剂盒）、逆转录标记（Cy3）、杂交实验，并与经过完全相同处理流程的标准文库（Cy5荧光标记）进行比对分析。