R-loops coordinate with SOX2 in regulating reprogramming to pluripotency
收藏干细胞与再生医学数据中心2021-12-14 更新2024-03-06 收录
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资源简介：
Gene expression profiling of reprogrammed cells with OSKM at different time points. Gene expression profiling of reprogrammed cells with OSKM plus control/RNaseH1/RNaseH1(D209N) at different time points. R-loops mapping of reprogrammed cells with OSKM at different time points. R-loops mapping of reprogrammed cells with OSKM plus control/RNaseH1/RNaseH1(D209N) at different time points. Chromatin accessibility analysis of reprogrammed cells with OSKM plus control/RNaseH1/RNaseH1(D209N) at different time points. CLIP-seq to identify Ddx5-associated RNAs.
于不同时间节点下，经OSKM诱导重编程的细胞的基因表达谱分析；于不同时间节点下，经OSKM联合空载对照/核糖核酸酶H1（RNaseH1）/核糖核酸酶H1突变体（RNaseH1(D209N)）处理的重编程细胞的基因表达谱分析；于不同时间节点下，经OSKM诱导重编程的细胞的R环（R-loops）定位分析；于不同时间节点下，经OSKM联合空载对照/核糖核酸酶H1（RNaseH1）/核糖核酸酶H1突变体（RNaseH1(D209N)）处理的重编程细胞的R环定位分析；于不同时间节点下，经OSKM联合空载对照/核糖核酸酶H1（RNaseH1）/核糖核酸酶H1突变体（RNaseH1(D209N)）处理的重编程细胞的染色质可及性分析；采用CLIP-seq技术鉴定与Ddx5结合的RNA分子
提供机构：
中国科学院广州生物医药与健康研究院
创建时间：
2021-12-14
