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Di-GRAPH exo1∆ dataset

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Zenodo2026-04-20 更新2026-05-29 收录
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https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.19661052
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The Di-GRAPH exo1∆ dataset contains paired-end FASTQ files obtained from S.cerevisiae PMV exo1∆ cells at 4 different timepoints: T0 (Timepoint 0, data prior to DSB induction), TSG (Timepoint Short Galactose, data from non-selected survivors), TLG (Timepoint Long Galactose, data from selected survivors) and TLR (Timepoint Long Raffinose, data from undamaged cells); and 3 replicates defined as E1 (Experiment 1), E2 (Experiment 2) and E3 (Experiment 3). This dataset can be used for test run of the Di-GRAPH bioinformatic workflow available at https://github.com/acb-lab/Di_GRAPH

Di-GRAPH 数据集(Di-GRAPH)exo1Δ包含从酿酒酵母(S.cerevisiae)PMV菌株exo1Δ突变体细胞中获取的双端FASTQ文件,涵盖4个不同时间点的样本:T0(时间点0,即DNA双链断裂(DSB)诱导前的测序数据)、TSG(半乳糖短时间诱导组,对应非筛选存活株的测序数据)、TLG(半乳糖长时间诱导组,对应筛选存活株的测序数据)以及TLR(棉子糖长时间培养组,对应未受损伤细胞的测序数据);同时设置了3次生物学重复,分别标记为E1(实验1)、E2(实验2)与E3(实验3)。 该数据集可用于测试运行公开于https://github.com/acb-lab/Di_GRAPH的Di-GRAPH生物信息学分析流程。
提供机构:
Zenodo
创建时间:
2026-04-20
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