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RemEff: sequences used for clustering

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DataCite Commons2020-08-25 更新2024-07-28 收录
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资源简介:
Data were collected from fungal sequences in the NCBI IPG and the UniParc databases, and from numerous curated published fungal genomes.<br>fungal_seqs.tsv.gz contains mappings of the non-redundant sequence names to identifiers in original databases.<br>fungal_seqs_curated_genomes.tsv.gz contains details of which sequences came from the curated genomes.<br>fungal_seqs_uniparc_signatures.tsv.gz gives details about InterPro terms present for sequences in the UniParc dataset.<br>fungal_seqs_uniparc_xrefs.tsv.gz maps ids from uniparc to references in other databases.<br>fungal_seqs_ipg.tsv gives details about sequences taken from the IPG database, mapping to other database identifiers.<br><br>

本数据集的数据采集自NCBI IPG、UniParc数据库中的真菌序列,以及大量经过人工审核整理的已发表真菌基因组。 fungal_seqs.tsv.gz 存储了非冗余序列名称与其在原始数据库中对应标识符的映射关系。 fungal_seqs_curated_genomes.tsv.gz 详细记录了各序列对应的来源整理基因组详情。 fungal_seqs_uniparc_signatures.tsv.gz 提供了UniParc数据集中序列所携带的InterPro注释条目详情。 fungal_seqs_uniparc_xrefs.tsv.gz 实现了UniParc标识符与其他数据库参考条目之间的交叉引用映射。 fungal_seqs_ipg.tsv 详细记录了从IPG数据库获取的序列信息,并完成了其与其他数据库标识符的映射。
提供机构:
figshare
创建时间:
2020-08-21
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54 个
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