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Core gene alignment of Mycoplasma genitalium isolates with Mycoplasma pneumoniae outgroup

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DataCite Commons2020-09-02 更新2024-07-25 收录
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资源简介:
This is a multi-FASTA alignment of the core genes of 24 Mycoplasma genitalium isolates with Mycoplasma pneumoniae as an outgroup. The core genes were detected with Roary with a blastp percentage identity of 75%. It comprises 264 genes and with a core of 174,384 bases, which is 30% of the size of M. genitalium genome.

本数据集为24株生殖道支原体(Mycoplasma genitalium)分离株的核心基因多序列FASTA比对文件,以肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae)作为外类群。核心基因通过Roary软件检测,比对时采用的BLASTp百分比同一性阈值为75%。该数据集共包含264个基因,核心基因总长度为174384个碱基,约占生殖道支原体基因组总大小的30%。
提供机构:
figshare
创建时间:
2017-08-08
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