CRISPRoffT

CRISPRoffT integrates results of off-target analysis from 74 studies, encompassing 29 experimental prediction techniques, 368 guide sequences, 226,164 potential guide and off-target pairs and 8,840 validated off-targets. CRISPRoffT features off-target data from different CRISPR approaches (knockout, base editing and prime editing) applied under diverse experimental conditions, including 85 different Cas/guide RNA (gRNA) combinations used across 34 different human and mouse cell lines. CRISPRoffT provides results of comparative analyses for individual guide sequences, genes, cell types, techniques and Cas/gRNA combinations under different conditions.CRISPRoffT 整合了74项研究的脱靶分析结果，涵盖29种实验预测技术、368条向导序列（guide sequence）、226,164对潜在向导-脱靶位点组合以及8,840个经验证的脱靶位点。该数据集收录了不同CRISPR技术路径（敲除（knockout）、碱基编辑（base editing）与先导编辑（prime editing））在多样实验条件下产生的脱靶数据，其中包含覆盖34种不同人类及小鼠细胞系的85种Cas/向导RNA（guide RNA，gRNA）组合。CRISPRoffT 还可提供不同实验条件下，针对单条向导序列、基因、细胞类型、预测技术以及Cas/gRNA组合的比较分析结果。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CRISPRoffT是一个综合数据库，整合了来自74项研究的CRISPR/Cas脱靶数据，涵盖29种预测技术、371个引导RNA序列和超过22.6万个潜在脱靶位点，其中包含8,940个实验验证的脱靶位点。它涉及85种Cas/gRNA组合、3种CRISPR编辑系统（如敲除和碱基编辑）以及34种人类和小鼠细胞系，提供比较分析功能，旨在支持CRISPR治疗应用的安全评估和预测算法开发。