Genomic Expression Archive

Genomic Expression Archive (GEA) is a public database of functional genomics data such as gene expression, epigenetics and genotyping SNP array. Both microarray- and sequence-based data are accepted in the MAGE-TAB format in compliance with MIAME and MINSEQE guidelines, respectively. GEA issues accession numbers, E-GEAD-n to experiment and A-GEAD-n to array design.基因组表达档案库（Genomic Expression Archive，GEA）是一座收录功能基因组学数据的公共数据库，涵盖基因表达、表观遗传学及单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism, SNP）基因分型芯片相关数据。基于微阵列与测序的两类数据，均可采用MAGE-TAB格式提交，其中微阵列数据需符合微阵列实验最低信息规范（Minimum Information About a Microarray Experiment, MIAME），测序数据需符合高通量测序实验最低信息规范（Minimum Information About a High-throughput Sequencing Experiment, MINSEQE）。该库为实验分配以E-GEAD-n为前缀的登录号，为芯片设计分配以A-GEAD-n为前缀的登录号。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

Genomic Expression Archive（GEA）是一个公共功能基因组学数据库，收录基因表达、表观遗传学和基因分型SNP阵列等数据。该数据库接受微阵列和测序数据，采用MAGE-TAB格式并分别遵循MIAME和MINSEQE指南。