人源肿瘤异种移植PDX-TA1药敏数据TAone.bw,TAone.volume
收藏国家人口健康科学数据中心2026-06-01 收录
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资源简介:
本软件使用的数据来自于公共数据集,TA1模式下PDX小鼠体重和肿瘤体积数据。本文件是肿瘤移植模型(Patient-derived xenograft,PDX)药效学数据分析系统软件的使用说明书。此软件是一个对PDX药敏数据进行分析的免费R软件。首先根据试验中肿瘤的数量、试验组的数量和来源于每个肿瘤分到每个试验组的动物数量,本软件将PDX药效学试验设计分为四种模式。然后,本软件提供了可对四种模式进行药效学分析,包括数据可视化、数据分析和结论呈现。数据分析模块的工具包括:利用统计分析方法来评估组间肿瘤体积的差异,通过计算肿瘤生长抑制率来量化药物反应,量化每一只动物的药物反应水平。本软件的主要输入是每只小鼠在每个时间点测量的肿瘤体积数据或小鼠体重数据;输出有多种类型,包括不同实验组之间肿瘤体积差异的显著性、不同实验组相对于对照组的肿瘤生长抑制率、每只小鼠的药敏反应级别、每个实验组的药敏反应评价指标等。 本软件的使用依赖于plyr、dplyr、nlme、ggplot2、rcompanion软件包。
提供机构:
上海交通大学创建时间:
2022-01-07



