ChEBI

ChEBI（Chemical Entities of Biological Interest）是一个关于生物相关化学实体的手动整理数据库和本体论。该数据库包含超过195,000个条目，涵盖自然分子和用于干预生物过程的合成化合物，但不包括基因组直接编码的大分子。ChEBI提供文本和结构搜索功能，并遵循国际纯粹与应用化学联合会(IUPAC)和国际生物化学与分子生物学联合会命名委员会(NC-IUBMB)的命名规范。ChEBI contains biologically relevant small molecules, along with chemical entity ontologies, their structures, synonyms, classifications, functional roles, and database cross-references. Provided by the European Bioinformatics Institute, this resource is utilized for metabolomics, chemical biology, and semantic compound annotation.

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

ChEBI是一个由欧洲生物信息学研究所维护的开放获取化学实体数据库和本体，包含超过195,000个手动整理的条目，涵盖小分子、化合物等。它支持基于文本和结构的查询，并遵循IUPAC等国际标准术语和分类，主要用于代谢组学、化学生物学及语义化化合物注释。