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银杉基因组及群体重测序数据集

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本数据集为银杉基因组与群体重测序数据集,包括基因组原始数据、组装结果数据、重测序数据、变异结果数据等文件。基因组数据的样本材料采自于重庆金佛山,经纬度坐标为107°13′25.42″E,29°3′17.15″N。在提取高质量DNA后,利用PacBio Revio测序平台获取HiFi reads,结合Hi-C染色体交互捕获技术,完成银杉染色体水平基因组组装。基于覆盖银杉自然分布区(107°8′59.32″E-113°43′18.28″E,24°10'0.12"N-29°14′53″N)的群体取样基础上,选取127个个体的健康叶片,提取高质量DNA并构建重测序文库,随后利用DNBSEQ-T7平台开展群体重测序工作。所有测序数据均经过去除接头、低质量序列等数据控制,获得高质量的净数据。依据高质量的银杉基因组与群体重测序数据,阐明银杉基因组多样性与变异式样,揭示银杉濒危的遗传机制和驱动因子,探究其适应潜力。本数据集不仅是濒危植物银杉重要的遗传信息资源,也可为种质资源保存、迁地保护管理等提供重要的保护策略。

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