Comprehensive Repository of Spatial Transcriptomics

CROST是一个空间转录组学综合数据库，存储了1,313个样本的表达和空间坐标信息，包含234个数据集、5种技术平台、11个物种和64种疾病数据。该数据库实现了标准化分析流程，整合了基因组学、表观基因组学和转录组学数据，用于研究癌症空间可变基因(SVG)，并提供单样本分析、交互式可视化和多组学集成等工具。

CROST is a comprehensive spatial transcriptomics database. It stores expression and spatial coordinate information from 1,313 samples, covering 234 datasets, 5 technical platforms, 11 species, and 64 disease-related datasets. Equipped with a standardized analytical workflow, this database integrates genomic, epigenomic and transcriptomic data to enable research on cancer spatial variable genes (SVGs), and provides tools including single-sample analysis, interactive visualization and multi-omics integration.

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

CROST是一个空间转录组学综合数据库，整合了来自234个数据集、5种技术平台、11个物种和64种疾病的1,313个样本表达与空间坐标信息。它通过标准化流程融合基因组学、表观基因组学和转录组学数据，支持癌症空间可变基因研究，并提供单样本分析、交互式可视化等工具。