ENCORI/starBase

ENCORI/starBase is an openly licensed and state-of-the-art platform to facilitate the integrative, interactive and versatile display of, as well as the comprehensive annotation and discovery of, RNA-RNA and protein-RNA interactions by developing new software and pipelines to deeply mining thousands of high-throughput sequencing data of RNA-RNA interactome, CLIP-seq and degradome sequencing (degradome-seq).ENCORI/starBase是一款采用开放许可协议的顶尖平台，通过开发新型软件与分析流程，对数千份RNA相互作用组（RNA-RNA interactome）、CLIP测序（CLIP-seq）及降解组测序（degradome-seq）的高通量测序数据进行深度挖掘，以此实现RNA-RNA与蛋白质-RNA相互作用的整合式、交互式、多功能展示，并完成相关相互作用的全面注释与发现。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

ENCORI/starBase是一个综合性的RNA相互作用图谱，整合了来自数千个CLIP-seq、降解组测序和RNA-RNA互作组数据，通过rbsSeeker和rriScan等工具系统识别RNA-RNA及蛋白质-RNA相互作用。该平台提供Pan-Cancer数据集、API和可视化工具，支持对非编码RNA、mRNA和RNA结合蛋白的调控机制进行深入研究。