1000G LD reference data

1000G.EUR.QC.bim/fam/bed are the 1000G dataset. fourier_ls-all.bed is the block file.ld_1kg_EUR_hm3_shrink.h5 is the LD file.

1000G.EUR.QC.bim、1000G.EUR.QC.fam 与 1000G.EUR.QC.bed 构成千人基因组计划（1000 Genomes Project）欧洲人群经质量控制（Quality Control, QC）的数据集。fourier_ls-all.bed 为区块文件。ld_1kg_EUR_hm3_shrink.h5 为连锁不平衡（Linkage Disequilibrium, LD）文件。

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背景与挑战

背景概述

该数据集是千人基因组计划（1000G）的连锁不平衡（LD）参考数据，专门针对欧洲人群（EUR）进行质量控制（QC），包含bed、bim、fam等格式的基因型文件以及LD矩阵文件（H5格式），总大小约6.41 GB。数据集主要用于全基因组关联研究（GWAS）和多基因风险评分（PRS）分析，为遗传统计和定量遗传学领域提供基础参考数据，采用CC BY 4.0开放许可协议。