ReMap

ReMap is an integrative analysis of Homo sapiens and Arabidopsis thaliana transcriptional regulators from DNA-binding experiments such as ChIP-seq, ChIP-exo, DAP-seq from public sources (GEO, ENCODE, ENA). The ReMap human atlas consists of 165 million (M) peaks from 1,135 transcription factors (TFs), transcription coactivators (TCAs) and chromatin-remodeling factors (CRFs). The ReMap Arabidopsis regulatory atlas consists of 2.6M peaks from 372 transcriptionnal regulators.ReMap是一项整合分析研究，其数据集源自公共数据源（GEO、ENCODE、ENA）中针对智人（Homo sapiens）与拟南芥（Arabidopsis thaliana）的转录调控因子开展的DNA结合实验，涵盖染色质免疫共沉淀测序（ChIP-seq）、染色质免疫共沉淀外切酶测序（ChIP-exo）及DNA亲和纯化测序（DAP-seq）。ReMap人类调控图谱包含来自1135个转录因子（TFs）、转录共激活因子（TCAs）与染色质重塑因子（CRFs）的共计1.65亿个测序峰。ReMap拟南芥调控图谱则包含来自372个转录调控因子的260万个测序峰。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

ReMap是一个整合分析数据库，专注于从公共DNA结合实验数据中解析智人和拟南芥的转录调控因子。人类图谱包含来自1,135个调控因子的1.65亿个峰，而拟南芥图谱则包含来自372个调控因子的260万个峰。