ctcRbase

ctcRbase collects expression data of circulating tumor cells/microemboli (CTCs/CTM) in all kinds of cancer types, including lncRNA and mRNA derived from RNA-seq data analyses. The first release of ctcRbase contains 526 CTCs/CTM samples across seven cancer types, and the expression of 14,631 mRNAs and 3,642 lncRNAs of CTCs/CTMs.ctcRbase 收录了多种癌症类型的循环肿瘤细胞/微瘤栓（CTCs/CTM）表达谱数据，其数据涵盖通过RNA测序（RNA-seq）数据分析得到的长链非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）与信使RNA（messenger RNA, mRNA）的表达信息。该数据库的首个正式版本包含覆盖7种癌症类型的526份CTCs/CTM样本，以及这些样本中14631个mRNA和3642个lncRNA的表达数据。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

ctcRbase是一个专注于循环肿瘤细胞/微栓子（CTCs/CTM）基因表达的数据库，收集了多种癌症类型中基于RNA-seq分析的mRNA和lncRNA表达数据。其首版包含526个样本，涵盖7种癌症类型，提供原发肿瘤、CTCs/CTM、白细胞及转移灶的表达信息，并支持在线查询与浏览。