AMIR

AMIR integrates diverse omics data from 74 species, encompassing 132 genomes, 4,408,432 genes annotated across seven different perspectives, 3897 transcriptome sequencing samples spanning 131 organs, tissues and stimuli, 42,765,290 unique variants and 15,662 metabolites genes. Leveraging these data, AMIR establishes the first pan-genome, comparative genomics and transcriptome system for the Asteraceae family. Furthermore, AMIR offers user-friendly tools designed to facilitate extensive customized bioinformatics analyses.AMIR整合了来自74个物种的多组学数据，涵盖132个基因组、从7种不同视角注释的4,408,432个基因、覆盖131个器官、组织及刺激条件的3,897个转录组测序样本、42,765,290个独特变异体以及15,662个代谢物基因。依托上述数据，AMIR构建了菊科（Asteraceae）首个泛基因组（pan-genome）、比较基因组学与转录组学研究体系。此外，AMIR还提供了用户友好型工具，以助力开展大规模定制化生物信息学分析。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

AMIR是一个专注于菊科植物的多组学信息平台，整合了74个物种的基因组、转录组和变异数据，构建了该植物家族的泛基因组与比较组学系统。该平台还提供了一系列生物信息学分析工具，支持用户进行自定义的数据挖掘和研究。