BIGSdb-Pasteur

BIGSdb-Pasteur hosts a collection of curated multilocus sequence typing (MLST), whole-genome based typing (core genome cgMLST) and supplementary schemes (antimicrobial resistance, virulence, ...) for bacterial pathogens of public health importance, including Klebsiella pneumoniae and Listeria monocytogenes.BIGSdb-Pasteur 数据库收录了一系列经人工整理的多位点序列分型（multilocus sequence typing, MLST）、全基因组分型（核心基因组MLST，cgMLST）及补充分型方案（如抗菌药物耐药性、毒力等），覆盖多种具有公共卫生重要性的细菌病原体，包括肺炎克雷伯菌（Klebsiella pneumoniae）与单核细胞增生李斯特菌（Listeria monocytogenes）。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

BIGSdb-Pasteur 是一个专注于鲍特氏菌（Bordetella）的基因型数据集，提供基于多基因座序列分型（MLST）和核心基因组MLST（cgMLST）的数据。它包括等位基因和谱型数据库以及分离株和基因组数据库，支持数据提交和社区驱动的管理，覆盖全球多个国家的分离株信息。