非天然氨基酸力场数据集

随着基因密码子扩展技术、代谢工程及动态调控策略的不断发展，非天然氨基酸将在合成生物学中发挥更核心的作用，推动生物制造、医疗健康及环境科学等领域的创新突破。其用途主要体现在功能拓展、结构优化、动态调控及新型生物系统构建等方面。通过计算模拟，将非天然氨基酸放入蛋白质元件的微环境中，考察非天然氨基酸插入对蛋白质元件结构与功能的影响。为了达到这一目标，分别采取经验打分函数（Rosetta力场）与量子化学模拟（Gaussian软件包）方式处理D型氨基酸和侧链修饰氨基酸。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集为非天然氨基酸的分子模拟提供力场参数，涵盖D型氨基酸和侧链修饰氨基酸。采用经验打分函数（Rosetta力场）与量子化学模拟（Gaussian软件）相结合的方法，以评估非天然氨基酸插入蛋白质元件后对结构功能的影响。数据包含多种格式文件（如sc、gjf、pdb等），适用于计算模拟研究。