SkeleDock tutorial files

Figshare2020-05-18 更新2026-04-08 收录

蛋白质-配体对接

药物虚拟筛选

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Files needed to reproduce SkeleDock's tutorial<br>

创建时间：

2020-05-18

DUD-E Diverse

药物虚拟筛选

化合物分类

该数据集是一个包含102个靶标和大约150万个化合物的全面配体数据集，旨在为虚拟筛选方法提供一个平衡的基准数据集。其中，“Diverse”子集包含了来自8个靶标和8个诱饵集的116,105个化合物，每个靶标对应使用一个诱饵集，并根据蛋白质类型将这些化合物分为7类。该数据集的规模属于大型，所涉及的任务是虚拟筛选。

arXiv440

Docking scores (kcal/mol) of GABA, ALA and MAL.

分子对接

药物虚拟筛选

Docking scores (kcal/mol) of GABA, ALA and MAL.

NIAID Data Ecosystem30

PPDock: Pocket Prediction-Based Protein–Ligand Blind Docking

蛋白质-配体对接

药物结合口袋预测

Predicting the docking conformation of a ligand in the protein binding site (pocket), i.e., protein–ligand docking, is crucial for drug discovery. Traditional docking methods have a long inference tim

Figshare20

List of compounds and weighted score for molecular docking.

分子对接

药物虚拟筛选

List of compounds and weighted score for molecular docking.

NIAID Data Ecosystem40

Additional file 8 of Uncovering leading compounds for alzheimer’s disease treatment: mendelian randomization and virtual screening insights into plasma protein modulation

药物虚拟筛选

阿尔茨海默病

Additional file 8.

Figshare2025-04-05 更新30