MPRAVarDB

MPRAVarDB is a specialized database and web server for exploring regulatory effects of 242,818 genetic variants from 18 MPRA experiments across >30 cell lines and 30 diseases/traits. It enables variant queries by genomic region, disease, or cell type, and provides pretrained machine-learning models to predict regulatory impacts in disease/cell-specific contexts.MPRAVarDB是一款专为探究遗传变异调控效应打造的专业数据库及网页服务平台，其收录了来自18项大规模平行报告基因检测（Massively Parallel Reporter Assay，简称MPRA）实验的242,818个遗传变异，相关实验覆盖超过30种细胞系与30种疾病/性状。该平台支持通过基因组区域、疾病或细胞类型开展变异查询，并提供预训练机器学习模型，以预测疾病或细胞特异性情境下的调控影响。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

MPRAVarDB是一个在线数据库和网络服务器，用于探索遗传变异的调控效应。它整合了来自18个大规模平行报告基因分析（MPRA）实验的242,818个变异数据，涵盖超过30种细胞系和30种疾病/性状，支持按基因组区域、疾病或细胞类型进行查询。此外，该数据库还提供了一系列预训练的机器学习模型，可用于在特定疾病或细胞背景下全基因组预测调控性因果变异。