Pancan-ncQTM

Pan-cancer ncQTM (Pancan-ncQTM) is a database we developed to provide a comprehensive resource of ncQTMs across 32 human cancer types (http://bigdata.njmu.edu.cn/Pancan-QTM/). In Pancan-ncQTM, we systematically evaluate the crosstalk between various RNAs (mRNA, miRNA, lncRNA, snRNA, snoRNA, and rRNA) and DNAm CpG sites in a pan-cancer setting from TCGA database.泛癌ncQTM（Pan-cancer ncQTM，简称Pancan-ncQTM）是本课题组开发的数据库，旨在为32种人类癌症类型的ncQTM提供全面的研究资源，其访问网址为http://bigdata.njmu.edu.cn/Pancan-QTM/。在Pancan-ncQTM数据库中，本课题组基于癌症基因组图谱（TCGA）数据库，在泛癌分析框架下系统评估了各类RNA（信使RNA[mRNA]、微小RNA[miRNA]、长链非编码RNA[lncRNA]、小核RNA[snRNA]、核仁小RNA[snoRNA]与核糖体RNA[rRNA]）与DNA甲基化CpG位点之间的相互作用。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

Pancan-ncQTM是一个涵盖32种人类癌症类型的数据库，旨在系统评估多种RNA与DNA甲基化CpG位点之间的相互作用。该数据库提供了泛癌症背景下非编码RNA-DNA甲基化关联的综合资源。