UniPep

There has been considerable recent interest in proteomic analyses of plasma for the purpose of discovering biomarkers. Profiling N-linked glycopeptides is a particularly promising method because the population of N-linked glycosites represents the proteomes of plasma, the cell surface, and secreted proteins at very low redundancy and provides a compelling link between the tissue and plasma proteomes. Here, we describe UniPep, a database of human N-linked glycosites - as a resource for biomarker discovery.

近年来，以发现生物标志物（biomarker）为目标的血浆蛋白质组学分析研究受到了广泛关注。对N连接糖肽（N-linked glycopeptides）进行谱图分析是一种极具前景的研究方法，这是由于N连接糖基化位点（N-linked glycosites）的集合能够以极低的冗余度覆盖血浆、细胞表面及分泌蛋白的蛋白质组，并可在组织蛋白质组与血浆蛋白质组之间建立起紧密的关联。本文介绍了UniPep——一款人类N连接糖基化位点数据库，可作为生物标志物发现的研究资源。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

Unipep是一个蛋白质组学数据集项目，提供来自瑞士联邦理工学院和系统生物学研究所的数据访问。初始阶段专注于潜在糖肽库，包含NxS/T基序的肽段，通过LC/MSMS实验和理论数据库映射；未来计划扩展至原型肽段存储库。