SFTSV致病机制研究的SFTSV感染Hela线粒体蛋白质组学测序数据集

（1）细胞培养与病毒感染：Hela细胞经标准化复苏、传代和培养后，以指定MOI（感染复数）接种SFTSV病毒液，在适宜条件下吸附后进行感染培养。 （2）线粒体分离与蛋白提取：感染后于指定时间点收集细胞，分离线粒体，裂解提取线粒体蛋白，经BCA法进行蛋白定量。 （3）蛋白酶解与标记：将获得的蛋白采用胰蛋白酶消化为肽段，将肽段脱盐处理后在Orbitrap Astral质谱仪上进行DIA检测； （4）质谱数据采集：对所有LC-MSMS检测得到的所有DIA原始数据导入DIA-NN进行分析，基于DIA-NN输出的蛋白定量结果进行生物信息分析流程。提取的线粒体蛋白经还原烷基化处理后，加入胰蛋白酶进行酶解。酶解后的多肽采用TMT（串联质谱标签）试剂进行标记。 （5）数据检索与定量分析：1）根据样本的来源情况构建样本特异性蛋白数据库，然后采用DIA数据分析软件DIA-NN进行蛋白数据库检索；2）基于数据库搜索的结果进行肽段和蛋白水平的质控分析；3）对鉴定到的蛋白进行常见功能注释；4）蛋白的定量分析：包含定量分布统计和重复性分析；5）差异蛋白筛选：包含差异显著性检验，差异数目统计。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

该数据集通过SFTSV感染Hela细胞后分离线粒体，提取蛋白并酶解为肽段，利用TMT标记和Orbitrap Astral质谱仪进行DIA检测，再经DIA-NN软件进行蛋白检索与定量分析。旨在揭示SFTSV感染后宿主线粒体蛋白组的动态变化，筛选差异表达蛋白，为基于宿主导向的抗病毒疗法提供蛋白层面的数据支持。