MicroPhenoDB

MicroPhenoDB is a database resource which manually collects and curates the data from the guideline of Infectious Diseases Society of America (IDSA) and the NCI pathogenic thesaurus (OBO Edition), includes microbe-disease association data from the HMDAD and Disbiome databases, and connects microbial core genes from the MetaPhlan2 dataset.MicroPhenoDB是一款数据库资源，其手动收集并经人工审核整理了来自美国传染病学会（Infectious Diseases Society of America，IDSA）指南以及美国国家癌症研究所（NCI）病原词库（开放生物医学本体版，OBO Edition）的数据，同时包含来自HMDAD与Disbiome数据库的微生物-疾病关联数据，并关联了MetaPhlan2数据集的微生物核心基因。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

MicroPhenoDB是一个微生物与疾病表型关联数据库，整合并收录了来自IDSA指南、NCI病原体词表以及HMDAD和Disbiome等数据库的数据，并连接了MetaPhlan2数据集的微生物核心基因。该数据库通过用户友好的Web界面和API提供服务，支持序列搜索应用，帮助用户快速识别病原微生物。