分子模拟数据集

分子模拟数据集该数据集是基于HPC-AI框架移植的示范案例“HPC-AI分子动力学模拟应用”的训练数据集，通过HPC-AI分子动力学模拟（MD）应用执行大规模MD模拟程序产生分子模拟数据，用于训练深度学习模型，指导分子模拟任务的配置参数调整。为了保证数据的客观准确性,由北京航空航天大学软件测评实验室于2024年6月进行第三方测试时产生，测试之前对测试条件、测试环境等进行了严格的检查和测量，确保了测试的有效性和数据的准确性。

分子模拟数据集是将IFME-unfolded.pdb数据集通过OpenMM分子动力学模拟工具包在GPU硬件上运行生成的数据集。PDB-1FME是小分子蛋白质 FSD-EY(PDBid:1FME) 溶液结构。该蛋白质包括 505 个原子，28 个氨基酸残基，折叠之后具有经典的β-β-α结构。