Cohorte familiale d’asthme du Saguenay-Lac-St-Jean (SLSJ asthma family cohort) – données de méthylation de l’ADN, génotypes et données sur le statut d’allergie alimentaire pour 114 individus (DNA methylation data, genetic data, and food allergy status for 114 individuals)

La cohorte familiale d’asthme du Saguenay-Lac-St-Jean est une cohorte créée en 1997 et maintenue par la professeure Catherine Laprise afin de récolter des données de santé générale, cliniques et génétiques (génome, épigénome et transcriptome) pour l'étude des facteurs génétiques et environnementaux de risque et de protection de l'asthme. Cette cohorte inclus 1 394 individus répartis à travers 271 familles. Les données génétiques de cet ensemble ont été générées lors du suivi des conditions de santé de 155 individus de la cohorte. De ces 155 individus, le phénotype de sensibilisation aux allergènes alimentaires a pu être confirmé par test cutané pour 114 individus. Pour ceux-ci, les données de méthylation de l’ADN, les génotypes ainsi que les données phénotypiques sont disponibles. Les données de méthylation proviennent d’un panel de séquençage ciblant les régions régulatrices des cellules immunes (5 233 004 sites CpG). Les génotypes proviennent de la puce Illumina Human610-quad suivi d’une étape d’imputations avec comme séquences de références celles du 1 000 Genome Project database (phase 3) et du projet UK10K (7 829 249 variants génétiques). _______________________________________________________________________________________ The Saguenay–Lac-Saint-Jean asthma family cohort is a cohort established in 1997 and maintained by Professor Catherine Laprise to collect general health, clinical, and genetic data (genome, epigenome, and transcriptome) for the study of genetic and environmental risk and protective factors for asthma. This cohort includes 1,394 individuals from 271 families. Genetic data were generated as part of the health condition follow-up for 155 individuals from the cohort. Among these, the food allergen sensitization phenotype was confirmed by skin prick testing in 114 individuals. For these individuals, DNA methylation data, genotypes, and phenotypic data are available. The DNA methylation data were obtained using a targeted sequencing panel focusing on regulatory regions of immune cells (5,233,004 CpG sites). Genotypes were generated using the Illumina Human610-Quad microarray, followed by an imputation step using reference sequences from the 1000 Genomes Project (phase 3) and the UK10K project (7,829,249 genetic variants).