BrainPalmSeq

We developed a web-tool that enables interactive visualization of the expression patterns for these proteins in the nervous system (http://brainpalmseq.med.ubc.ca/), and explored this resource to find region and cell-type specific expression patterns that give insight into the function of palmitoylating and de-palmitoylating enzymes in the brain and neurological disorders. We found coordinated expression of ZDHHC enzymes with their accessory proteins, de-palmitoylating enzymes and other brain-expressed genes that included an enrichment of S-palmitoylation substrates.本研究开发了一款网页工具，可实现神经系统内上述蛋白质表达模式的交互式可视化（访问网址：http://brainpalmseq.med.ubc.ca/）；并依托该资源筛选得到具有区域及细胞类型特异性的表达模式，以此深入解析脑内棕榈酰化酶与去棕榈酰化酶的功能，以及其在神经系统疾病中的作用机制。本研究还发现，ZDHHC酶与其辅助蛋白、去棕榈酰化酶及其他脑表达基因存在协同表达现象，其中还富集了S-棕榈酰化底物。

搜集汇总

背景与挑战

背景概述

BrainPalmSeq是一个用于可视化神经系统蛋白质表达模式的网络工具，可用于探索大脑区域和细胞类型特异性表达模式，以研究棕榈酰化与去棕榈酰化酶的功能及其与神经疾病的关联。该资源还揭示了ZDHHC酶与其辅助蛋白、去棕榈酰化酶及其他大脑表达基因之间的协调表达关系。